. RNA-seqによる遺伝子発現の解析とは?原理やメリット・デメリットを解説! - 生命科学ラボ
RNA-seqによる遺伝子発現の解析とは?原理やメリット・デメリットを解説! - 生命科学ラボ
RNA-seqによる遺伝子発現の解析とは?原理やメリット・デメリットを解説! - 生命科学ラボ

RNA-seqによる遺伝子発現の解析とは?原理やメリット・デメリットを解説!

リアルタイムPCRでの遺伝子定量の原理と方法、研究・医療での活用方法 皆さんはリアルタイムPCR(real-time PCR)について説明できますか?また、実際にリアルタイムPCRを使って遺伝子発現の解析.

  • 解析に数日~数週間かかる
  • データが膨大になるため、専用サーバーが必要
リアルタイムPCRと比較したときのメリット 細胞に存在する全てのmRNA配列を網羅的に検出できる
  • 配列が未知のmRNAも定量できる
  • 事前に発現しそうな遺伝子領域を予測する必要がない
リアルタイムPCRと比較したときのデメリット 解析に数日~数週間かかる データが膨大になるため、専用サーバーが必要

リアルタイムPCRでの遺伝子定量の原理と方法、研究・医療での活用方法 皆さんはリアルタイムPCR(real-time PCR)について説明できますか?また、実際にリアルタイムPCRを使って遺伝子発現の解析.

DNAマイクロアレイ法との比較

DNAマイクロアレイ法で遺伝子発現を網羅的に解析する原理と医療現場での活用法 皆さんはDNAマイクロアレイ法について説明できますか?また、実際にDNAマイクロアレイを使った解析ができますか? 「DNAマイク.

  • 未知の遺伝子も検出できる
  • 発現量の少ないmRNAの検索性能が高い
  • 解析データサイズが大きい
  • 解析にかかる時間が長い
DNAマイクロアレイ法と比較したときのメリット 未知の遺伝子も検出できる 発現量の少ないmRNAの検索性能が高い DNAマイクロアレイ法と比較したときのデメリット 解析データサイズが大きい 解析にかかる時間が長い

DNAマイクロアレイ法で遺伝子発現を網羅的に解析する原理と医療現場での活用法 皆さんはDNAマイクロアレイ法について説明できますか?また、実際にDNAマイクロアレイを使った解析ができますか? 「DNAマイク.

遺伝子発現の定量以外でのRNA-seq活用法

バリアント 融合遺伝子 一塩基多型

まとめ

RNA-seqの原理と目的
  1. 細胞からmRNAを抽出
  2. mRNAを断片化
  3. 2本鎖のcDNAを合成
  4. 両側の末端にアダプターをつける
  5. シーケンシング
  6. マッピング
遺伝子発現の定量以外にできる解析
  • バリアント解析
  • 融合遺伝子の解析
  • 一塩基多型の解析
📎📎📎📎📎📎📎📎📎📎